《特殊使命》分集剧情介绍第36集
此时已经明确了地下党身份的柴云生用钱财引诱机要室的刘参谋，并设计从刘参谋处复制了保险柜钥匙，并设法交到巩向光手中。
按地下党的计划，一方面柴云生将刘参谋调虎离山，一方面巩向光进入机要室获取进攻延安的计划。但余沁斋的突然到来，使巩向光无法脱身。在陈静雷的的协助下，巩向光终于拿到了计划并交给地下党。
巩向光的举动似乎证实了余雪瑶的怀疑，余雪瑶当面说出巩向光的真实身份，并劝巩向光回头。在巩向光的劝说下，余雪瑶开始站在了他的一边。
边国烈召集巩向光重要会议，结果却是携他及一批军事要员秘密前往前线，准备开始进攻延安的军事行动，并确定了进攻时间。巩向光将写有情报的密信托人带给刘菊芳。
余沁斋对刘菊芳已有所怀疑，于是派特务盯着她。地下党发现刘菊芳处在危险之中，多次让她离开巩向光家，但她担心无人传递情报还是留了下来。
余沁斋来到了巩向光家，向余雪瑶了解刘菊芳的情况，余雪瑶为她遮遮掩掩。
《特殊使命》分集剧情介绍第37集
边国烈率军进攻延安，为找到延安的中央机关，军统调来了新式侦测设备，恰被巩向光遇到。巩向光再次向刘菊芳传回情报。
余沁斋的到来，使余雪瑶感到刘菊芳已身处险境，于是委婉地劝她马上离开自己家。刘菊芳为传送情报，答应明天就走，结果却失踪了。
余雪瑶找到余沁斋询问刘菊芳的下落，才得知她被捕后自尽身亡。
边国烈进攻延安又以失败告终，巩向光随边国烈回到渭城。
巩向光回家后，得知刘菊芳牺牲的消息十分悲痛，余雪瑶也为刘菊芳的死而懊悔不已。余雪瑶意识到自己的大哥与丈夫是势不两立的敌人后，必须作出痛苦而艰难的选择。
解放军即将解放渭城，地下党让巩向光设法获取敌人的潜伏名单和破坏计划。
文启智虽然被提升为副主任，但他见局势每况日下，准备为自己找条后路。巩向光答应帮助他，但要求他交出潜伏名单，文启智最终答应用三根金条交换。
余沁斋找到余雪瑶，也希望她在自己和巩向光之间做出选择。
《特殊使命》分集剧情介绍第38集
巩向光正为筹集金条而苦恼，余雪瑶得知后将自己的嫁妆拿出。巩向光和余雪瑶正在准备金条时，恰被前来的余沁斋发现。余雪瑶为巩向光作伪证，差点儿被余沁斋识破，巩向光则巧妙地搪塞过去。此时，余沁斋终于明白，自己的妹妹已经彻底地倒向了巩向光。
肖文富的妻子催促肖文富赶快逃离渭城，巩向光前来说服肖文富交出破坏计划和潜伏名单，被肖文富拒绝。
巩向光得到文启智的名单后，正要离家去送给地下党。余沁斋恰好赶来，要见巩向光。余雪瑶一面暗中帮助巩向光悄悄离开，一面阻止余沁斋，然而女佣王妈却透露出巩向光的去向。余沁斋立即集合人马赶赴古塔公园。
巩向光在古塔公园准备与洪定坤接头，余雪瑶突然赶来，劝他离开，并告诉他余沁斋前来抓他。巩向光为保护洪定坤坚决不走，余雪瑶也要跟巩向光在一起。余雪瑶被特务误认为是与巩向光接头的共产党，于是余沁斋下令击毙。
《特殊使命》分集剧情介绍第39集
余沁斋指挥特务开了枪，余雪瑶被误击身亡。巩向光悲怒万分，痛打余沁斋。余沁斋得知自己杀的是自己的妹妹时，也失声痛哭起来。
肖文富最终同意交出计划和名单，并要求与地下党见面。洪定坤与之相见，给了他所要的钱财，但肖文富为安全起见，只交出了计划却未交出名单。
面对解放军的攻势，边国烈已无力抵抗，于是报请蒋介石批准“撤退”。就在边国烈安排逃跑时，他却让巩向光留下，并将巩母作为人质随军带走。为了完成自己的使命，巩向光只得把母亲送往边国烈军中。
地下党得知巩向光母亲的事情后，立即派申北汉联络游击队去营救。
严锟也在准备随边国烈一起逃跑。临行前，他任命肖文富为渭城军统站的站长。肖文富明知自己是被当作替死鬼，却不能不表面上答应，而背地里却在找后路。他几次找巩向光均未找到，于是在家中留下暗号，约巩向光见面。
巩向光如约与肖文富相见，就在肖文富把名单交给巩向光时，一直跟踪在后的朱然突然出现。
朱然开枪打死了正要逃跑的肖文富，再举枪要杀巩向光时，欧阳荷突然出现将朱然击毙。巩向光这时才意识到，欧阳荷一直在保护着自己。
边国烈等重要军事官员逃离渭城，欧阳荷也随之而去，巩向光与欧阳荷依依相别。
余沁斋与巩向光相约在公园相见，以做个最后的了断。两人一场对决之后，余沁斋败得哑口无言，最终自杀身亡。
渭城终于解放，巩向光也实现了自己回到党的怀抱的愿望。
解放后的某一天，正在墓地祭奠的巩向光突然接到通知，说是有人从前线特地赶到渭城来看他。等到见面后才发现，来的人正是欧阳荷。然而短暂的一面之后，两人又不得不再度分手。直到分手时，他也不知道对方的真实姓名。
（全剧终）
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